Nejvíce rostlin kvete na Zakynthosu na jaře. Uvidíte například sasanky, vstavače, tulipány či bramboříky. S prvními podzimními srážkami začínají kvést ladoňky, krokusy, ocúny a mnoho dalších.
V zálivu Laganas se u jižní části ostrova Zakynthos nachází jeden ze dvou řeckých mořských národních parků. V této oblasti se vyskytují vzácné a přísně chráněné želvy caretta caretta. Pláže v oblasti Laganas a Gerakas, na něž samice kladou svá vejce, jsou v daném období v nočních hodinách zavřené. Omezen je i provoz letiště.
U ostrůvku Pelouzo se vyskytuje velmi ohrožený tuleň středozemní. Dále na Zakynthosu žijí některé druhy plazů, jako jsou třeba ještěrky.
