I na malé rozloze Bahrajnu lze objevit zajímavou a cennou přírodu. Několik takových míst se dočkalo ochrany v podobě přírodní rezervace:
Na Bahrajnu roste na 200 druhů stromů a rostlin, nejběžnější jsou datlové palmy, citrusovníky a tolice vojtěška. K turistickým atrakcím patří 10 metrů vysoký a 400 let starý naditec označovaný jako „strom života“. Na vrcholu písečné duny asi 6 kilometrů od kopce Džabal ad-Duchán přežívá po staletí bez zdroje podzemní vody.
K typickým živočichům ostrova se řadí přímorožec arabský (národní zvíře), gazela, zajíc a ježek. Vy však uvidíte spíše velbloudy a koně chované na četných farmách. K obyvatelům Bahrajnu se počítá i přes 300 ptačích druhů (často migrujících) a ve vodách Perského zálivu se daří korálům, želvám, delfínům a dugongům.
