Kefalonská fauna není příliš bohatá. Je zastoupena především ptactvem (více než 200 druhů) a drobnými živočichy (ještěrky, hmyz atd.). Ve vnitrozemí však občas můžete spatřit stáda divokých koní, uprostřed lesů žije i kuna evropská. U břehů se vyskytují dva ohrožené druhy mořských živočichů: kareta obecná (často hnízdí na plážích na jihu) a tuleň středomořský (s oblibou obývá nepřístupné úseky pobřeží, aby se vyhnul kontaktu s člověkem).
